大葱收获机指出大葱根腐病与沤根症状相似，属真菌性病害。是一种由腐霉、镰刀菌、疫霉等多种病原侵染引起的病害。患病大葱叶尖发黄，随后萎缩枯死，其根茎部组织变黑、腐烂，根系逐步坏死，最终导致死苗、死棵。一般情况下，葱沟内积水或大水漫灌后，再遇高温天气时，发病重。
防治措施包括：1.多年种植大葱的地块，应与其他作物轮作，注意不要与大蒜、韭菜轮作。2.科学合理施用基肥、追肥，注意增施有机肥，一般每亩施有机肥3000～5000公斤，磷肥采用普钙效果较佳。追肥应采用氮、钾肥相结合的复混或复合肥。3.在大葱培土前，可随水冲施生物菌肥，或者用58%的甲霜灵锰锌600～800倍液或70%的霜脲氰锰锌800～1000倍液灌根，然后进行培土。培土后，若发现病株，要及时扒开垄土，施入72%普力克800倍液、96%的恶霉灵3000倍液灌根防治。对于蝼蛄、葱蛆等害虫，可用辛硫磷颗粒、毒死蜱颗粒等杀虫剂来防治。4.雨后及时排水、中耕，以增加大葱根部土壤的透气性。
重茬是造成大葱根腐病的关键因素，由于连续多年种植，土壤中病原菌增多，重茬病害在所难免，极易造成大葱根腐死棵。若在培土时，土壤湿度过大，则影响根部正常呼吸，使植物自身抗性下降，会加剧病害的发生。